Pada kepengurusan tahun 2022, Markaz Hidayah Qur’an memiliki struktur kepengurusan sebagai berikut.

Markaz Hidayah Quran terdiri dari inti yang meliputi Mudir , Sekretaris, Bendahara Umum, Pengasuhan, Kurikulum dan para pengajar yang sudah ahli di bidangnya

Pengurus Inti

Mudir : Ustadz Arfatul Hidayat

Bendahara  : Ustadzah Neneng Wardah

Sekretaris : Ustadzah Putu Raihani Rarasma

Bendahara Umum : Ustadzah Annida Nur Fauzia

Kurikulum : Ustadzah Aisyah Aksara H.

Pengasuhan : Ustadzah Nela Rizlah 

Pengajar 

1. Ustadzah Annida Nurfauzia mengajar Bahasa Arab

2. Ustadzah Putu Raihani Rarasma mengajar Talaqqi Bacaan Al-Qur’an

3. Ustadzah Muallif Kutub mengajar Kitab Tibyan

Keamanan 

Ayuni Nadhroh

Ubudiyyah

Ani Setiani

Kebersihan

Siti Nur Halizah

Kesehatan 

Ramisah Khaerani